Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms