Protein–RNA interactions for Protein: P42357

HAL, Histidine ammonia-lyase, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HALP42357 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HALP42357 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HALP42357 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HALP42357 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HALP42357 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HALP42357 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HALP42357 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HALP42357 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HALP42357 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HALP42357 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HALP42357 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HALP42357 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HALP42357 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HALP42357 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HALP42357 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HALP42357 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HALP42357 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HALP42357 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HALP42357 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HALP42357 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HALP42357 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HALP42357 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HALP42357 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HALP42357 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HALP42357 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HALP42357 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HALP42357 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HALP42357 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HALP42357 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HALP42357 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HALP42357 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HALP42357 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HALP42357 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HALP42357 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HALP42357 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HALP42357 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HALP42357 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HALP42357 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HALP42357 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HALP42357 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HALP42357 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HALP42357 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HALP42357 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HALP42357 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HALP42357 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HALP42357 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HALP42357 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HALP42357 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HALP42357 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HALP42357 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HALP42357 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HALP42357 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HALP42357 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HALP42357 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HALP42357 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HALP42357 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HALP42357 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HALP42357 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HALP42357 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HALP42357 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HALP42357 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HALP42357 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HALP42357 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HALP42357 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HALP42357 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HALP42357 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HALP42357 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HALP42357 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HALP42357 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HALP42357 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HALP42357 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HALP42357 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HALP42357 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HALP42357 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HALP42357 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HALP42357 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HALP42357 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HALP42357 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HALP42357 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HALP42357 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HALP42357 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HALP42357 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HALP42357 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HALP42357 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HALP42357 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HALP42357 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HALP42357 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HALP42357 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HALP42357 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HALP42357 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HALP42357 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HALP42357 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HALP42357 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HALP42357 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HALP42357 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HALP42357 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HALP42357 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HALP42357 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HALP42357 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HALP42357 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms