Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIK3CAP42336 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms