Protein–RNA interactions for Protein: P41271

NBL1, Neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBL1P41271 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBL1P41271 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBL1P41271 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBL1P41271 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBL1P41271 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NBL1P41271 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBL1P41271 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBL1P41271 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBL1P41271 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBL1P41271 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBL1P41271 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBL1P41271 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NBL1P41271 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBL1P41271 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBL1P41271 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NBL1P41271 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBL1P41271 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBL1P41271 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBL1P41271 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBL1P41271 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBL1P41271 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBL1P41271 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBL1P41271 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBL1P41271 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBL1P41271 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBL1P41271 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBL1P41271 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NBL1P41271 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBL1P41271 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NBL1P41271 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBL1P41271 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBL1P41271 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBL1P41271 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBL1P41271 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBL1P41271 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBL1P41271 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBL1P41271 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBL1P41271 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBL1P41271 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBL1P41271 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NBL1P41271 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBL1P41271 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBL1P41271 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBL1P41271 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBL1P41271 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBL1P41271 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBL1P41271 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBL1P41271 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBL1P41271 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NBL1P41271 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NBL1P41271 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NBL1P41271 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBL1P41271 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBL1P41271 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBL1P41271 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NBL1P41271 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBL1P41271 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBL1P41271 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBL1P41271 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBL1P41271 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBL1P41271 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBL1P41271 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBL1P41271 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBL1P41271 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBL1P41271 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBL1P41271 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBL1P41271 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBL1P41271 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBL1P41271 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBL1P41271 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBL1P41271 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBL1P41271 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NBL1P41271 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBL1P41271 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NBL1P41271 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NBL1P41271 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NBL1P41271 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBL1P41271 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBL1P41271 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBL1P41271 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBL1P41271 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBL1P41271 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBL1P41271 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBL1P41271 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBL1P41271 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBL1P41271 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBL1P41271 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBL1P41271 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBL1P41271 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBL1P41271 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBL1P41271 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBL1P41271 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBL1P41271 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBL1P41271 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NBL1P41271 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBL1P41271 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBL1P41271 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBL1P41271 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBL1P41271 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBL1P41271 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms