Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCAP37840 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCAP37840 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCAP37840 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCAP37840 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCAP37840 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCAP37840 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCAP37840 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCAP37840 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCAP37840 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCAP37840 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCAP37840 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCAP37840 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCAP37840 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCAP37840 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNCAP37840 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCAP37840 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCAP37840 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCAP37840 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCAP37840 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCAP37840 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCAP37840 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCAP37840 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCAP37840 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCAP37840 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCAP37840 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCAP37840 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCAP37840 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCAP37840 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCAP37840 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCAP37840 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCAP37840 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCAP37840 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCAP37840 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCAP37840 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCAP37840 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCAP37840 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCAP37840 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCAP37840 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCAP37840 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCAP37840 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCAP37840 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCAP37840 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCAP37840 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCAP37840 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCAP37840 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCAP37840 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCAP37840 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCAP37840 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCAP37840 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCAP37840 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCAP37840 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCAP37840 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCAP37840 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCAP37840 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCAP37840 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCAP37840 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCAP37840 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCAP37840 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCAP37840 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCAP37840 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCAP37840 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCAP37840 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCAP37840 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCAP37840 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCAP37840 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCAP37840 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCAP37840 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCAP37840 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCAP37840 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCAP37840 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCAP37840 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCAP37840 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCAP37840 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCAP37840 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCAP37840 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCAP37840 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCAP37840 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCAP37840 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCAP37840 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCAP37840 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCAP37840 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCAP37840 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCAP37840 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCAP37840 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCAP37840 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCAP37840 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCAP37840 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCAP37840 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCAP37840 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCAP37840 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCAP37840 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCAP37840 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCAP37840 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCAP37840 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCAP37840 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCAP37840 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCAP37840 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCAP37840 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCAP37840 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms