Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms