Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX5P35711 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX5P35711 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX5P35711 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX5P35711 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX5P35711 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX5P35711 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX5P35711 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX5P35711 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX5P35711 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX5P35711 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX5P35711 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX5P35711 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX5P35711 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX5P35711 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX5P35711 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOX5P35711 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOX5P35711 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOX5P35711 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX5P35711 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX5P35711 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX5P35711 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX5P35711 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX5P35711 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX5P35711 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX5P35711 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX5P35711 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX5P35711 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX5P35711 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX5P35711 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX5P35711 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX5P35711 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX5P35711 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX5P35711 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX5P35711 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX5P35711 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX5P35711 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX5P35711 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX5P35711 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX5P35711 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX5P35711 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX5P35711 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX5P35711 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX5P35711 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX5P35711 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX5P35711 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX5P35711 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX5P35711 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX5P35711 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX5P35711 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX5P35711 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX5P35711 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX5P35711 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX5P35711 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX5P35711 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX5P35711 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX5P35711 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX5P35711 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX5P35711 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX5P35711 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX5P35711 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX5P35711 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX5P35711 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX5P35711 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX5P35711 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX5P35711 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX5P35711 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX5P35711 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX5P35711 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX5P35711 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX5P35711 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX5P35711 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX5P35711 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX5P35711 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX5P35711 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX5P35711 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX5P35711 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX5P35711 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX5P35711 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX5P35711 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX5P35711 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX5P35711 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX5P35711 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX5P35711 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX5P35711 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX5P35711 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX5P35711 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX5P35711 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX5P35711 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SOX5P35711 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SOX5P35711 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX5P35711 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX5P35711 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX5P35711 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX5P35711 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX5P35711 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX5P35711 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX5P35711 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX5P35711 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX5P35711 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms