Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN2P35609 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN2P35609 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms