Protein–RNA interactions for Protein: P32189

GK, Glycerol kinase, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKP32189 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKP32189 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKP32189 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKP32189 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKP32189 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKP32189 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKP32189 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKP32189 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKP32189 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKP32189 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKP32189 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKP32189 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKP32189 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKP32189 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKP32189 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKP32189 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKP32189 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKP32189 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKP32189 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKP32189 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GKP32189 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKP32189 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKP32189 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GKP32189 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKP32189 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKP32189 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GKP32189 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKP32189 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKP32189 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKP32189 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKP32189 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKP32189 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKP32189 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKP32189 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKP32189 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKP32189 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKP32189 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKP32189 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKP32189 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKP32189 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GKP32189 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKP32189 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKP32189 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKP32189 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKP32189 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKP32189 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKP32189 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GKP32189 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GKP32189 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKP32189 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKP32189 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKP32189 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKP32189 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKP32189 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKP32189 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GKP32189 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GKP32189 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKP32189 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKP32189 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKP32189 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKP32189 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKP32189 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKP32189 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKP32189 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKP32189 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKP32189 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKP32189 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKP32189 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GKP32189 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GKP32189 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GKP32189 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKP32189 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKP32189 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKP32189 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKP32189 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKP32189 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKP32189 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKP32189 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKP32189 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKP32189 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKP32189 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKP32189 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKP32189 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKP32189 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKP32189 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GKP32189 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKP32189 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKP32189 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKP32189 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GKP32189 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GKP32189 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GKP32189 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKP32189 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKP32189 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKP32189 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKP32189 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKP32189 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GKP32189 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GKP32189 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GKP32189 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms