Protein–RNA interactions for Protein: P30203

CD6, T-cell differentiation antigen CD6, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6P30203 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD6P30203 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD6P30203 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD6P30203 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD6P30203 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD6P30203 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD6P30203 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD6P30203 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD6P30203 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD6P30203 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD6P30203 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD6P30203 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD6P30203 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD6P30203 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD6P30203 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD6P30203 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD6P30203 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD6P30203 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD6P30203 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD6P30203 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD6P30203 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD6P30203 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD6P30203 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD6P30203 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD6P30203 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD6P30203 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD6P30203 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD6P30203 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD6P30203 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD6P30203 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD6P30203 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD6P30203 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD6P30203 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD6P30203 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD6P30203 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD6P30203 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD6P30203 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD6P30203 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD6P30203 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD6P30203 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD6P30203 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD6P30203 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD6P30203 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD6P30203 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD6P30203 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD6P30203 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD6P30203 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CD6P30203 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD6P30203 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD6P30203 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CD6P30203 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD6P30203 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD6P30203 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD6P30203 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD6P30203 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD6P30203 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CD6P30203 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD6P30203 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD6P30203 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD6P30203 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD6P30203 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD6P30203 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD6P30203 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD6P30203 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD6P30203 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD6P30203 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD6P30203 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD6P30203 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD6P30203 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD6P30203 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD6P30203 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD6P30203 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD6P30203 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD6P30203 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD6P30203 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD6P30203 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD6P30203 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD6P30203 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD6P30203 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD6P30203 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD6P30203 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD6P30203 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD6P30203 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD6P30203 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD6P30203 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD6P30203 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD6P30203 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD6P30203 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD6P30203 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD6P30203 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD6P30203 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD6P30203 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD6P30203 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD6P30203 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD6P30203 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD6P30203 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD6P30203 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD6P30203 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD6P30203 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD6P30203 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms