Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CD38P28907 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD38P28907 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD38P28907 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD38P28907 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD38P28907 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD38P28907 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD38P28907 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD38P28907 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD38P28907 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD38P28907 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD38P28907 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD38P28907 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD38P28907 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD38P28907 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD38P28907 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD38P28907 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD38P28907 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD38P28907 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD38P28907 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD38P28907 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD38P28907 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD38P28907 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD38P28907 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD38P28907 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD38P28907 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD38P28907 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD38P28907 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD38P28907 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD38P28907 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD38P28907 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD38P28907 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD38P28907 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD38P28907 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD38P28907 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD38P28907 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD38P28907 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD38P28907 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD38P28907 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD38P28907 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD38P28907 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD38P28907 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD38P28907 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD38P28907 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD38P28907 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD38P28907 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD38P28907 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD38P28907 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD38P28907 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD38P28907 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CD38P28907 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD38P28907 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD38P28907 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD38P28907 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD38P28907 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD38P28907 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CD38P28907 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD38P28907 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CD38P28907 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD38P28907 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD38P28907 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD38P28907 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD38P28907 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD38P28907 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD38P28907 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD38P28907 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD38P28907 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD38P28907 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD38P28907 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD38P28907 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD38P28907 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD38P28907 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD38P28907 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD38P28907 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD38P28907 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD38P28907 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD38P28907 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD38P28907 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD38P28907 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD38P28907 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CD38P28907 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD38P28907 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD38P28907 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CD38P28907 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD38P28907 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD38P28907 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD38P28907 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD38P28907 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD38P28907 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD38P28907 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD38P28907 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD38P28907 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD38P28907 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD38P28907 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD38P28907 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD38P28907 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD38P28907 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD38P28907 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD38P28907 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD38P28907 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms