Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTFP26441 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTFP26441 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTFP26441 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTFP26441 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTFP26441 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTFP26441 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTFP26441 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTFP26441 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTFP26441 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTFP26441 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTFP26441 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTFP26441 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTFP26441 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTFP26441 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTFP26441 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTFP26441 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTFP26441 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTFP26441 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTFP26441 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTFP26441 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTFP26441 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTFP26441 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTFP26441 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTFP26441 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTFP26441 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTFP26441 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTFP26441 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTFP26441 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTFP26441 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTFP26441 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTFP26441 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTFP26441 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTFP26441 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTFP26441 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTFP26441 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTFP26441 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTFP26441 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTFP26441 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTFP26441 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTFP26441 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTFP26441 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTFP26441 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTFP26441 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTFP26441 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTFP26441 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTFP26441 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTFP26441 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTFP26441 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTFP26441 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTFP26441 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTFP26441 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTFP26441 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTFP26441 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTFP26441 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTFP26441 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTFP26441 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTFP26441 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTFP26441 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTFP26441 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTFP26441 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTFP26441 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTFP26441 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTFP26441 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTFP26441 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTFP26441 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTFP26441 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTFP26441 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTFP26441 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTFP26441 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTFP26441 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTFP26441 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTFP26441 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTFP26441 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTFP26441 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTFP26441 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTFP26441 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTFP26441 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTFP26441 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTFP26441 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTFP26441 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTFP26441 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTFP26441 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTFP26441 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTFP26441 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTFP26441 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTFP26441 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTFP26441 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTFP26441 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTFP26441 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTFP26441 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTFP26441 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTFP26441 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTFP26441 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTFP26441 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTFP26441 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTFP26441 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTFP26441 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTFP26441 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTFP26441 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms