Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2B4P23634 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2B4P23634 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2B4P23634 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B4P23634 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B4P23634 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B4P23634 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B4P23634 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B4P23634 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B4P23634 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B4P23634 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B4P23634 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B4P23634 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B4P23634 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B4P23634 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B4P23634 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B4P23634 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B4P23634 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B4P23634 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B4P23634 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B4P23634 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2B4P23634 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2B4P23634 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2B4P23634 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2B4P23634 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2B4P23634 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2B4P23634 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2B4P23634 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2B4P23634 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B4P23634 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B4P23634 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B4P23634 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B4P23634 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B4P23634 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B4P23634 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B4P23634 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B4P23634 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2B4P23634 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2B4P23634 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATP2B4P23634 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2B4P23634 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2B4P23634 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2B4P23634 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATP2B4P23634 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2B4P23634 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2B4P23634 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms