Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRZ1P23471 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms