Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms