Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms