Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1D1P20393 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms