Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A1P19634 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms