Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI1P19237 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms