Protein–RNA interactions for Protein: P17706

PTPN2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN2P17706 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms