Protein–RNA interactions for Protein: P17706

PTPN2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN2P17706 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN2P17706 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN2P17706 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms