Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STMN1P16949 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STMN1P16949 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STMN1P16949 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STMN1P16949 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STMN1P16949 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STMN1P16949 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STMN1P16949 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STMN1P16949 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STMN1P16949 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STMN1P16949 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STMN1P16949 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STMN1P16949 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STMN1P16949 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STMN1P16949 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STMN1P16949 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STMN1P16949 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STMN1P16949 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STMN1P16949 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STMN1P16949 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STMN1P16949 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STMN1P16949 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STMN1P16949 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STMN1P16949 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STMN1P16949 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STMN1P16949 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STMN1P16949 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STMN1P16949 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STMN1P16949 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STMN1P16949 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STMN1P16949 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STMN1P16949 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STMN1P16949 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STMN1P16949 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STMN1P16949 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STMN1P16949 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STMN1P16949 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STMN1P16949 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STMN1P16949 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STMN1P16949 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STMN1P16949 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STMN1P16949 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STMN1P16949 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STMN1P16949 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STMN1P16949 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STMN1P16949 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STMN1P16949 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STMN1P16949 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STMN1P16949 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STMN1P16949 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STMN1P16949 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STMN1P16949 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STMN1P16949 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STMN1P16949 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STMN1P16949 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STMN1P16949 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STMN1P16949 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STMN1P16949 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STMN1P16949 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STMN1P16949 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STMN1P16949 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STMN1P16949 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STMN1P16949 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STMN1P16949 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STMN1P16949 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STMN1P16949 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STMN1P16949 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STMN1P16949 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STMN1P16949 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STMN1P16949 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STMN1P16949 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STMN1P16949 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STMN1P16949 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STMN1P16949 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STMN1P16949 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STMN1P16949 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STMN1P16949 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STMN1P16949 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STMN1P16949 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STMN1P16949 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STMN1P16949 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STMN1P16949 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STMN1P16949 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STMN1P16949 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STMN1P16949 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STMN1P16949 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STMN1P16949 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STMN1P16949 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STMN1P16949 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STMN1P16949 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STMN1P16949 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STMN1P16949 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STMN1P16949 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STMN1P16949 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STMN1P16949 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STMN1P16949 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STMN1P16949 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STMN1P16949 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STMN1P16949 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STMN1P16949 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms