Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP10827 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP10827 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP10827 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP10827 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP10827 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP10827 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP10827 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP10827 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP10827 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP10827 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP10827 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP10827 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP10827 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP10827 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP10827 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP10827 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP10827 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP10827 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP10827 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP10827 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP10827 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP10827 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP10827 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP10827 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP10827 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP10827 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP10827 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP10827 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP10827 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP10827 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP10827 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP10827 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP10827 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP10827 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP10827 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP10827 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP10827 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP10827 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP10827 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP10827 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP10827 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP10827 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP10827 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP10827 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP10827 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP10827 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP10827 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP10827 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP10827 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP10827 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP10827 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP10827 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THRAP10827 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
THRAP10827 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THRAP10827 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THRAP10827 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP10827 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP10827 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP10827 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP10827 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP10827 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP10827 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP10827 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP10827 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP10827 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP10827 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP10827 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP10827 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP10827 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP10827 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP10827 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP10827 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP10827 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP10827 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP10827 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP10827 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP10827 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP10827 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP10827 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP10827 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP10827 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP10827 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP10827 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP10827 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP10827 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP10827 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP10827 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP10827 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP10827 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP10827 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP10827 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP10827 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP10827 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP10827 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP10827 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP10827 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP10827 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP10827 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP10827 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms