Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TGFB3P10600 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TGFB3P10600 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TGFB3P10600 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TGFB3P10600 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TGFB3P10600 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TGFB3P10600 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TGFB3P10600 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TGFB3P10600 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TGFB3P10600 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TGFB3P10600 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TGFB3P10600 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TGFB3P10600 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TGFB3P10600 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TGFB3P10600 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms