Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CALM2P0DP24 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CALM2P0DP24 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CALM2P0DP24 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALM2P0DP24 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALM2P0DP24 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms