Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms