Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
RGPD2P0DJD1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms