Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TNP1P09430 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TNP1P09430 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TNP1P09430 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
TNP1P09430 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TNP1P09430 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TNP1P09430 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TNP1P09430 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TNP1P09430 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TNP1P09430 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
TNP1P09430 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TNP1P09430 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TNP1P09430 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TNP1P09430 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TNP1P09430 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TNP1P09430 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TNP1P09430 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TNP1P09430 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TNP1P09430 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TNP1P09430 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TNP1P09430 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TNP1P09430 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TNP1P09430 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TNP1P09430 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TNP1P09430 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TNP1P09430 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TNP1P09430 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TNP1P09430 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TNP1P09430 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TNP1P09430 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TNP1P09430 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TNP1P09430 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TNP1P09430 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TNP1P09430 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TNP1P09430 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TNP1P09430 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TNP1P09430 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TNP1P09430 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TNP1P09430 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TNP1P09430 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
TNP1P09430 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms