Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT19P08727 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT19P08727 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT19P08727 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT19P08727 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT19P08727 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT19P08727 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT19P08727 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT19P08727 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT19P08727 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT19P08727 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT19P08727 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT19P08727 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT19P08727 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT19P08727 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT19P08727 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT19P08727 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT19P08727 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT19P08727 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT19P08727 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT19P08727 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT19P08727 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT19P08727 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT19P08727 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT19P08727 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT19P08727 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT19P08727 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT19P08727 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT19P08727 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT19P08727 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT19P08727 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT19P08727 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT19P08727 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT19P08727 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT19P08727 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT19P08727 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT19P08727 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT19P08727 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT19P08727 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT19P08727 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT19P08727 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT19P08727 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT19P08727 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT19P08727 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT19P08727 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT19P08727 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT19P08727 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT19P08727 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT19P08727 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT19P08727 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT19P08727 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT19P08727 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT19P08727 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT19P08727 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT19P08727 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT19P08727 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT19P08727 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT19P08727 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT19P08727 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT19P08727 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT19P08727 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT19P08727 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT19P08727 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT19P08727 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT19P08727 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT19P08727 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT19P08727 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT19P08727 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT19P08727 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT19P08727 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT19P08727 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT19P08727 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT19P08727 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT19P08727 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT19P08727 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT19P08727 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT19P08727 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT19P08727 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT19P08727 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT19P08727 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT19P08727 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT19P08727 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT19P08727 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT19P08727 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT19P08727 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT19P08727 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT19P08727 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT19P08727 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT19P08727 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT19P08727 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT19P08727 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT19P08727 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT19P08727 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT19P08727 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT19P08727 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT19P08727 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT19P08727 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT19P08727 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT19P08727 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT19P08727 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms