Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IL3P08700 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IL3P08700 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IL3P08700 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IL3P08700 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IL3P08700 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IL3P08700 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IL3P08700 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IL3P08700 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IL3P08700 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IL3P08700 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IL3P08700 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IL3P08700 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IL3P08700 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IL3P08700 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IL3P08700 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IL3P08700 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IL3P08700 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IL3P08700 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IL3P08700 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IL3P08700 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IL3P08700 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IL3P08700 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IL3P08700 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IL3P08700 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IL3P08700 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IL3P08700 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IL3P08700 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IL3P08700 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IL3P08700 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IL3P08700 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IL3P08700 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IL3P08700 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IL3P08700 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IL3P08700 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IL3P08700 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IL3P08700 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IL3P08700 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IL3P08700 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IL3P08700 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IL3P08700 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IL3P08700 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IL3P08700 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
IL3P08700 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IL3P08700 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
IL3P08700 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IL3P08700 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IL3P08700 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IL3P08700 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IL3P08700 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IL3P08700 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IL3P08700 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IL3P08700 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IL3P08700 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IL3P08700 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IL3P08700 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IL3P08700 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IL3P08700 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IL3P08700 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IL3P08700 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IL3P08700 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
IL3P08700 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IL3P08700 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IL3P08700 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IL3P08700 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IL3P08700 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IL3P08700 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IL3P08700 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IL3P08700 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IL3P08700 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IL3P08700 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
IL3P08700 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IL3P08700 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IL3P08700 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IL3P08700 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IL3P08700 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IL3P08700 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IL3P08700 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IL3P08700 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IL3P08700 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IL3P08700 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IL3P08700 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IL3P08700 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IL3P08700 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IL3P08700 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IL3P08700 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IL3P08700 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IL3P08700 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IL3P08700 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IL3P08700 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IL3P08700 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IL3P08700 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IL3P08700 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IL3P08700 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IL3P08700 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IL3P08700 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IL3P08700 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IL3P08700 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IL3P08700 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IL3P08700 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms