Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM2P07951 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM2P07951 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM2P07951 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM2P07951 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM2P07951 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM2P07951 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM2P07951 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM2P07951 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM2P07951 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM2P07951 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM2P07951 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM2P07951 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM2P07951 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPM2P07951 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPM2P07951 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPM2P07951 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPM2P07951 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPM2P07951 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPM2P07951 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPM2P07951 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPM2P07951 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPM2P07951 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPM2P07951 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM2P07951 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM2P07951 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM2P07951 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM2P07951 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM2P07951 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM2P07951 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM2P07951 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM2P07951 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM2P07951 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM2P07951 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM2P07951 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM2P07951 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM2P07951 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM2P07951 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM2P07951 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM2P07951 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM2P07951 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM2P07951 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM2P07951 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM2P07951 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM2P07951 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM2P07951 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM2P07951 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM2P07951 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM2P07951 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM2P07951 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM2P07951 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM2P07951 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM2P07951 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM2P07951 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM2P07951 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM2P07951 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM2P07951 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM2P07951 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM2P07951 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM2P07951 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM2P07951 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM2P07951 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM2P07951 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM2P07951 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM2P07951 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPM2P07951 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPM2P07951 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPM2P07951 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPM2P07951 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPM2P07951 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPM2P07951 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPM2P07951 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TPM2P07951 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPM2P07951 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPM2P07951 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TPM2P07951 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TPM2P07951 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TPM2P07951 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TPM2P07951 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM2P07951 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM2P07951 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM2P07951 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM2P07951 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM2P07951 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM2P07951 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM2P07951 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM2P07951 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM2P07951 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM2P07951 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM2P07951 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM2P07951 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM2P07951 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM2P07951 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM2P07951 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM2P07951 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM2P07951 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM2P07951 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM2P07951 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM2P07951 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM2P07951 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms