Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYNP07948 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LYNP07948 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYNP07948 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYNP07948 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYNP07948 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYNP07948 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYNP07948 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYNP07948 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYNP07948 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYNP07948 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYNP07948 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYNP07948 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYNP07948 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYNP07948 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYNP07948 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYNP07948 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYNP07948 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYNP07948 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYNP07948 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYNP07948 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYNP07948 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYNP07948 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYNP07948 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYNP07948 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYNP07948 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYNP07948 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYNP07948 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYNP07948 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYNP07948 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYNP07948 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYNP07948 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYNP07948 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYNP07948 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYNP07948 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYNP07948 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYNP07948 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LYNP07948 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYNP07948 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYNP07948 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYNP07948 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYNP07948 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYNP07948 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYNP07948 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYNP07948 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYNP07948 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYNP07948 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYNP07948 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYNP07948 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYNP07948 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LYNP07948 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LYNP07948 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LYNP07948 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LYNP07948 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LYNP07948 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LYNP07948 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LYNP07948 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LYNP07948 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LYNP07948 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LYNP07948 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LYNP07948 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LYNP07948 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LYNP07948 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LYNP07948 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYNP07948 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYNP07948 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYNP07948 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYNP07948 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYNP07948 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYNP07948 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYNP07948 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYNP07948 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYNP07948 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYNP07948 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYNP07948 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYNP07948 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYNP07948 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYNP07948 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYNP07948 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYNP07948 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYNP07948 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYNP07948 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYNP07948 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYNP07948 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYNP07948 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYNP07948 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYNP07948 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYNP07948 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYNP07948 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYNP07948 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYNP07948 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYNP07948 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYNP07948 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYNP07948 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYNP07948 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYNP07948 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYNP07948 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYNP07948 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYNP07948 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYNP07948 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms