Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB1P05556 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms