Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYBBP04839 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYBBP04839 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CYBBP04839 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CYBBP04839 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYBBP04839 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYBBP04839 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYBBP04839 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYBBP04839 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYBBP04839 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYBBP04839 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYBBP04839 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYBBP04839 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CYBBP04839 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYBBP04839 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYBBP04839 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CYBBP04839 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYBBP04839 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYBBP04839 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYBBP04839 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CYBBP04839 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CYBBP04839 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYBBP04839 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYBBP04839 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYBBP04839 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYBBP04839 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYBBP04839 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYBBP04839 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYBBP04839 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYBBP04839 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYBBP04839 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CYBBP04839 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYBBP04839 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYBBP04839 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYBBP04839 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYBBP04839 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYBBP04839 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYBBP04839 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYBBP04839 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYBBP04839 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYBBP04839 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYBBP04839 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYBBP04839 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYBBP04839 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYBBP04839 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYBBP04839 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYBBP04839 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYBBP04839 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYBBP04839 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYBBP04839 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYBBP04839 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CYBBP04839 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYBBP04839 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYBBP04839 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYBBP04839 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYBBP04839 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYBBP04839 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYBBP04839 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYBBP04839 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYBBP04839 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYBBP04839 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYBBP04839 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYBBP04839 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CYBBP04839 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CYBBP04839 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYBBP04839 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYBBP04839 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CYBBP04839 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYBBP04839 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYBBP04839 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYBBP04839 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYBBP04839 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYBBP04839 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYBBP04839 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYBBP04839 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CYBBP04839 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYBBP04839 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYBBP04839 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYBBP04839 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYBBP04839 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYBBP04839 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYBBP04839 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYBBP04839 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYBBP04839 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYBBP04839 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYBBP04839 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYBBP04839 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYBBP04839 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYBBP04839 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYBBP04839 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYBBP04839 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CYBBP04839 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYBBP04839 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYBBP04839 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CYBBP04839 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CYBBP04839 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CYBBP04839 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CYBBP04839 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CYBBP04839 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYBBP04839 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms