Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGAP02671 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGAP02671 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGAP02671 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGAP02671 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGAP02671 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGAP02671 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGAP02671 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGAP02671 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGAP02671 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FGAP02671 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGAP02671 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGAP02671 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGAP02671 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGAP02671 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGAP02671 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FGAP02671 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FGAP02671 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGAP02671 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGAP02671 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGAP02671 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGAP02671 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FGAP02671 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGAP02671 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGAP02671 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGAP02671 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGAP02671 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGAP02671 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGAP02671 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGAP02671 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGAP02671 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGAP02671 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGAP02671 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGAP02671 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGAP02671 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGAP02671 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGAP02671 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGAP02671 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGAP02671 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
FGAP02671 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FGAP02671 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGAP02671 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGAP02671 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGAP02671 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGAP02671 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGAP02671 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGAP02671 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGAP02671 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGAP02671 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGAP02671 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FGAP02671 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGAP02671 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGAP02671 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGAP02671 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGAP02671 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGAP02671 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGAP02671 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGAP02671 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGAP02671 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGAP02671 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGAP02671 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGAP02671 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FGAP02671 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGAP02671 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGAP02671 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGAP02671 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGAP02671 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGAP02671 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGAP02671 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGAP02671 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGAP02671 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGAP02671 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGAP02671 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGAP02671 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGAP02671 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGAP02671 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGAP02671 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGAP02671 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGAP02671 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGAP02671 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGAP02671 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGAP02671 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGAP02671 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGAP02671 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGAP02671 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGAP02671 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FGAP02671 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGAP02671 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGAP02671 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGAP02671 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGAP02671 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FGAP02671 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGAP02671 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGAP02671 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGAP02671 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGAP02671 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGAP02671 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGAP02671 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGAP02671 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGAP02671 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms