Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFP01375 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFP01375 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFP01375 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFP01375 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFP01375 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFP01375 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFP01375 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFP01375 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFP01375 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFP01375 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFP01375 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFP01375 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFP01375 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFP01375 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFP01375 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFP01375 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFP01375 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFP01375 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFP01375 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFP01375 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFP01375 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFP01375 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFP01375 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFP01375 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFP01375 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFP01375 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFP01375 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFP01375 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFP01375 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFP01375 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFP01375 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFP01375 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFP01375 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFP01375 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFP01375 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFP01375 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFP01375 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFP01375 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFP01375 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFP01375 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFP01375 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFP01375 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFP01375 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFP01375 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFP01375 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFP01375 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFP01375 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFP01375 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFP01375 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFP01375 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFP01375 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFP01375 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFP01375 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFP01375 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFP01375 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFP01375 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFP01375 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFP01375 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFP01375 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFP01375 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFP01375 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFP01375 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFP01375 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFP01375 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFP01375 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFP01375 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFP01375 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFP01375 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFP01375 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFP01375 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFP01375 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFP01375 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFP01375 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFP01375 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNFP01375 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFP01375 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFP01375 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFP01375 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFP01375 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFP01375 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFP01375 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFP01375 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFP01375 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFP01375 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFP01375 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFP01375 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNFP01375 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFP01375 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFP01375 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFP01375 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFP01375 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFP01375 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFP01375 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFP01375 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFP01375 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFP01375 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFP01375 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFP01375 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFP01375 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms