Protein–RNA interactions for Protein: P01034

CST3, Cystatin-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST3P01034 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CST3P01034 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CST3P01034 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CST3P01034 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CST3P01034 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CST3P01034 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CST3P01034 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CST3P01034 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CST3P01034 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CST3P01034 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CST3P01034 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CST3P01034 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CST3P01034 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CST3P01034 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CST3P01034 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CST3P01034 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CST3P01034 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CST3P01034 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CST3P01034 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CST3P01034 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CST3P01034 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CST3P01034 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CST3P01034 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CST3P01034 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CST3P01034 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CST3P01034 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CST3P01034 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CST3P01034 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CST3P01034 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CST3P01034 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CST3P01034 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CST3P01034 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CST3P01034 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CST3P01034 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CST3P01034 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CST3P01034 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CST3P01034 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CST3P01034 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CST3P01034 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CST3P01034 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CST3P01034 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CST3P01034 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST3P01034 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST3P01034 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST3P01034 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST3P01034 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST3P01034 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST3P01034 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST3P01034 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST3P01034 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST3P01034 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST3P01034 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST3P01034 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CST3P01034 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CST3P01034 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CST3P01034 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CST3P01034 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CST3P01034 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CST3P01034 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CST3P01034 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CST3P01034 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CST3P01034 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CST3P01034 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CST3P01034 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CST3P01034 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CST3P01034 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CST3P01034 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CST3P01034 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CST3P01034 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CST3P01034 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CST3P01034 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CST3P01034 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CST3P01034 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CST3P01034 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CST3P01034 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CST3P01034 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST3P01034 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST3P01034 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST3P01034 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST3P01034 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST3P01034 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST3P01034 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST3P01034 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST3P01034 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST3P01034 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST3P01034 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms