Protein–RNA interactions for Protein: P01034

CST3, Cystatin-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST3P01034 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CST3P01034 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CST3P01034 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CST3P01034 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CST3P01034 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CST3P01034 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CST3P01034 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CST3P01034 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CST3P01034 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CST3P01034 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CST3P01034 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CST3P01034 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CST3P01034 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CST3P01034 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CST3P01034 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CST3P01034 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CST3P01034 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CST3P01034 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CST3P01034 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CST3P01034 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CST3P01034 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CST3P01034 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CST3P01034 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CST3P01034 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CST3P01034 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CST3P01034 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CST3P01034 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CST3P01034 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CST3P01034 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CST3P01034 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CST3P01034 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CST3P01034 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CST3P01034 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CST3P01034 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CST3P01034 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CST3P01034 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CST3P01034 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CST3P01034 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CST3P01034 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CST3P01034 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CST3P01034 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CST3P01034 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST3P01034 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST3P01034 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST3P01034 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST3P01034 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST3P01034 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST3P01034 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST3P01034 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST3P01034 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST3P01034 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST3P01034 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST3P01034 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CST3P01034 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CST3P01034 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CST3P01034 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CST3P01034 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CST3P01034 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CST3P01034 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CST3P01034 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CST3P01034 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CST3P01034 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST3P01034 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CST3P01034 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CST3P01034 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CST3P01034 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CST3P01034 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CST3P01034 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CST3P01034 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CST3P01034 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CST3P01034 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CST3P01034 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CST3P01034 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CST3P01034 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CST3P01034 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CST3P01034 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CST3P01034 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST3P01034 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST3P01034 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST3P01034 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST3P01034 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST3P01034 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST3P01034 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST3P01034 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST3P01034 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST3P01034 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST3P01034 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms