Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
STAMBPO95630 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms