Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF6BO95407 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms