Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCC1O94876 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms