Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIOO75962 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIOO75962 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIOO75962 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIOO75962 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIOO75962 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIOO75962 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIOO75962 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIOO75962 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIOO75962 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIOO75962 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIOO75962 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIOO75962 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIOO75962 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIOO75962 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIOO75962 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIOO75962 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIOO75962 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIOO75962 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIOO75962 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIOO75962 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIOO75962 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIOO75962 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIOO75962 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIOO75962 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIOO75962 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIOO75962 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIOO75962 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIOO75962 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIOO75962 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIOO75962 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIOO75962 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIOO75962 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIOO75962 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIOO75962 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIOO75962 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIOO75962 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIOO75962 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIOO75962 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIOO75962 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIOO75962 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIOO75962 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIOO75962 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIOO75962 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIOO75962 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIOO75962 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIOO75962 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIOO75962 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIOO75962 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIOO75962 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIOO75962 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIOO75962 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIOO75962 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIOO75962 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIOO75962 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIOO75962 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIOO75962 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIOO75962 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIOO75962 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIOO75962 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIOO75962 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIOO75962 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIOO75962 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIOO75962 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIOO75962 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIOO75962 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIOO75962 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIOO75962 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIOO75962 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIOO75962 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIOO75962 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIOO75962 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIOO75962 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIOO75962 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIOO75962 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIOO75962 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIOO75962 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIOO75962 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIOO75962 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIOO75962 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIOO75962 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIOO75962 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIOO75962 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIOO75962 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIOO75962 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIOO75962 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIOO75962 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIOO75962 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIOO75962 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIOO75962 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIOO75962 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIOO75962 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIOO75962 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIOO75962 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIOO75962 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIOO75962 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIOO75962 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIOO75962 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIOO75962 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIOO75962 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms