Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN5O75503 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN5O75503 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN5O75503 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN5O75503 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN5O75503 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN5O75503 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN5O75503 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN5O75503 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN5O75503 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN5O75503 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN5O75503 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN5O75503 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN5O75503 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN5O75503 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN5O75503 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN5O75503 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN5O75503 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN5O75503 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN5O75503 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN5O75503 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN5O75503 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN5O75503 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN5O75503 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN5O75503 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN5O75503 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN5O75503 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN5O75503 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN5O75503 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN5O75503 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN5O75503 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN5O75503 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN5O75503 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN5O75503 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN5O75503 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN5O75503 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN5O75503 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN5O75503 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN5O75503 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN5O75503 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN5O75503 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN5O75503 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN5O75503 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN5O75503 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN5O75503 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN5O75503 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN5O75503 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN5O75503 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN5O75503 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN5O75503 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN5O75503 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN5O75503 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN5O75503 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN5O75503 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN5O75503 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN5O75503 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN5O75503 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN5O75503 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN5O75503 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN5O75503 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN5O75503 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN5O75503 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN5O75503 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN5O75503 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN5O75503 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN5O75503 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN5O75503 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN5O75503 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN5O75503 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN5O75503 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN5O75503 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN5O75503 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN5O75503 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN5O75503 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN5O75503 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN5O75503 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN5O75503 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN5O75503 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN5O75503 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN5O75503 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN5O75503 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN5O75503 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN5O75503 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLN5O75503 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN5O75503 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN5O75503 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN5O75503 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN5O75503 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN5O75503 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN5O75503 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN5O75503 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN5O75503 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN5O75503 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN5O75503 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN5O75503 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN5O75503 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN5O75503 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN5O75503 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN5O75503 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN5O75503 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms