Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F6O75461 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F6O75461 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F6O75461 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F6O75461 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F6O75461 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F6O75461 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F6O75461 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F6O75461 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F6O75461 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F6O75461 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F6O75461 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F6O75461 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F6O75461 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F6O75461 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F6O75461 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F6O75461 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F6O75461 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F6O75461 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F6O75461 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F6O75461 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F6O75461 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F6O75461 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F6O75461 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F6O75461 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F6O75461 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F6O75461 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F6O75461 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F6O75461 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F6O75461 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F6O75461 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F6O75461 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F6O75461 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F6O75461 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F6O75461 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F6O75461 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F6O75461 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F6O75461 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F6O75461 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F6O75461 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F6O75461 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F6O75461 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F6O75461 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F6O75461 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F6O75461 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F6O75461 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F6O75461 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F6O75461 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F6O75461 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F6O75461 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F6O75461 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F6O75461 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F6O75461 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F6O75461 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F6O75461 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F6O75461 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F6O75461 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F6O75461 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F6O75461 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F6O75461 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F6O75461 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F6O75461 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F6O75461 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F6O75461 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F6O75461 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F6O75461 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F6O75461 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F6O75461 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F6O75461 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F6O75461 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F6O75461 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F6O75461 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F6O75461 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F6O75461 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F6O75461 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms