Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD2O60548 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD2O60548 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms