Protein–RNA interactions for Protein: O60245

PCDH7, Protocadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH7O60245 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PCDH7O60245 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH7O60245 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms