Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELR3O43731 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms