Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MSH5O43196 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MSH5O43196 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MSH5O43196 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MSH5O43196 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MSH5O43196 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
MSH5O43196 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
MSH5O43196 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MSH5O43196 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
MSH5O43196 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MSH5O43196 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MSH5O43196 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MSH5O43196 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MSH5O43196 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MSH5O43196 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MSH5O43196 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MSH5O43196 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
MSH5O43196 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MSH5O43196 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MSH5O43196 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MSH5O43196 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MSH5O43196 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
MSH5O43196 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MSH5O43196 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MSH5O43196 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MSH5O43196 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MSH5O43196 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MSH5O43196 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MSH5O43196 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MSH5O43196 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MSH5O43196 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MSH5O43196 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MSH5O43196 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MSH5O43196 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MSH5O43196 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MSH5O43196 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MSH5O43196 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MSH5O43196 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MSH5O43196 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MSH5O43196 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MSH5O43196 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MSH5O43196 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MSH5O43196 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MSH5O43196 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MSH5O43196 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MSH5O43196 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MSH5O43196 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
MSH5O43196 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MSH5O43196 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MSH5O43196 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MSH5O43196 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MSH5O43196 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MSH5O43196 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MSH5O43196 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
MSH5O43196 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MSH5O43196 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
MSH5O43196 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
MSH5O43196 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
MSH5O43196 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MSH5O43196 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MSH5O43196 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MSH5O43196 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
MSH5O43196 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MSH5O43196 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MSH5O43196 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MSH5O43196 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MSH5O43196 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MSH5O43196 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MSH5O43196 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MSH5O43196 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MSH5O43196 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MSH5O43196 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MSH5O43196 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MSH5O43196 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MSH5O43196 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MSH5O43196 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MSH5O43196 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MSH5O43196 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MSH5O43196 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
MSH5O43196 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MSH5O43196 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MSH5O43196 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MSH5O43196 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MSH5O43196 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MSH5O43196 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MSH5O43196 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MSH5O43196 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MSH5O43196 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MSH5O43196 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MSH5O43196 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
MSH5O43196 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MSH5O43196 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MSH5O43196 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
MSH5O43196 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MSH5O43196 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MSH5O43196 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
MSH5O43196 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MSH5O43196 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
MSH5O43196 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MSH5O43196 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms