Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms