Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP290O15078 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP290O15078 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP290O15078 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP290O15078 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP290O15078 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP290O15078 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP290O15078 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP290O15078 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP290O15078 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP290O15078 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP290O15078 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP290O15078 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP290O15078 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP290O15078 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP290O15078 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP290O15078 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP290O15078 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP290O15078 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP290O15078 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP290O15078 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP290O15078 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP290O15078 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP290O15078 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP290O15078 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP290O15078 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP290O15078 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP290O15078 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP290O15078 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP290O15078 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP290O15078 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP290O15078 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP290O15078 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP290O15078 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP290O15078 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP290O15078 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP290O15078 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP290O15078 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP290O15078 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP290O15078 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP290O15078 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP290O15078 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP290O15078 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP290O15078 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP290O15078 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP290O15078 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP290O15078 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP290O15078 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP290O15078 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP290O15078 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP290O15078 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP290O15078 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP290O15078 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP290O15078 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP290O15078 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP290O15078 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP290O15078 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP290O15078 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP290O15078 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP290O15078 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP290O15078 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP290O15078 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP290O15078 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP290O15078 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP290O15078 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP290O15078 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP290O15078 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP290O15078 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP290O15078 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP290O15078 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP290O15078 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP290O15078 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP290O15078 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP290O15078 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP290O15078 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP290O15078 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP290O15078 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP290O15078 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP290O15078 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP290O15078 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP290O15078 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP290O15078 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP290O15078 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP290O15078 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP290O15078 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP290O15078 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP290O15078 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP290O15078 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP290O15078 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP290O15078 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP290O15078 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP290O15078 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP290O15078 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP290O15078 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP290O15078 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP290O15078 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP290O15078 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP290O15078 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP290O15078 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP290O15078 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
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