Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAMP3O14828 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms