Protein–RNA interactions for Protein: O00712

NFIB, Nuclear factor 1 B-type, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIBO00712 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIBO00712 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIBO00712 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIBO00712 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIBO00712 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIBO00712 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIBO00712 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIBO00712 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIBO00712 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIBO00712 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIBO00712 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIBO00712 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIBO00712 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIBO00712 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIBO00712 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIBO00712 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIBO00712 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIBO00712 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIBO00712 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIBO00712 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIBO00712 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIBO00712 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIBO00712 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIBO00712 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIBO00712 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIBO00712 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIBO00712 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIBO00712 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NFIBO00712 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIBO00712 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIBO00712 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIBO00712 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIBO00712 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIBO00712 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIBO00712 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIBO00712 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIBO00712 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIBO00712 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIBO00712 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIBO00712 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIBO00712 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIBO00712 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIBO00712 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIBO00712 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIBO00712 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIBO00712 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIBO00712 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIBO00712 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIBO00712 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIBO00712 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIBO00712 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIBO00712 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIBO00712 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIBO00712 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIBO00712 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIBO00712 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIBO00712 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIBO00712 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIBO00712 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIBO00712 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIBO00712 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIBO00712 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIBO00712 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIBO00712 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIBO00712 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIBO00712 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIBO00712 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIBO00712 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIBO00712 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIBO00712 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIBO00712 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIBO00712 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIBO00712 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIBO00712 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIBO00712 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFIBO00712 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIBO00712 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIBO00712 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIBO00712 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIBO00712 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIBO00712 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIBO00712 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIBO00712 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIBO00712 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIBO00712 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIBO00712 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIBO00712 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIBO00712 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIBO00712 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIBO00712 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIBO00712 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIBO00712 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIBO00712 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIBO00712 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIBO00712 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIBO00712 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIBO00712 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIBO00712 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIBO00712 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIBO00712 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms